VIRAL – CISML Data Hub

Filtros en Vivo (multi-select)

Area

Tipo Encuentro

Grupo de Edad

Diagnostico

IRA Superior / Inferior

Genero

Ninos / Adultos

Semana Desde

Semana Hasta

Gravedad IRA

Severidad Compuesta

Tipo Paciente

Riesgo Reingreso

Turno Ingreso

Capitulo CIE-10

Filtros SIVIGILA (multi-select)

Tipo de Dato

Canal / Edad

Territorial

Año

Semanas

Prescripciones

0

Con Cultivo

0%

Servicios

0

Top 10 Antibióticos

Diagnósticos

Por Servicio

Vía de Administración

Análisis Temporal de Prescripciones

Antibióticos

Diagnóstico

Servicios

Indicación

Desde

Hasta

Granularidad

IRA / No IRA

Clasif. Respiratoria

Grupo de Edad

Rango de edad en meses (0-60m)

a meses

Períodos rápidos

Registros filtrados: 0

Semanas: 0

Ranking en Período Seleccionado

% IRA vs No IRA — Evolución Temporal

Proporción de prescripciones respiratorias vs no respiratorias por período — respeta todos los filtros activos

Prescripciones por Grupo de Edad

Distribución de prescripciones filtradas por rango etario

% IRA por Grupo de Edad

Proporción IRA vs No IRA en cada grupo etario

Registros de Prescripciones

Total: 0 registros (desde 2023)

Fecha	ID Paciente	Servicio	Diagnóstico	Antibiótico 1	Antibiótico 2	Indicación	Vía	Cultivo

Subir Consolidado de Virología — CISML

Excel con hojas: FILMARRAY (PCR molecular), PANELES (antígenos rápidos), COVID (PCR/antígeno). Se procesan las 3 hojas automáticamente.

Subir Excel

CONTROL DE CALIDAD - Totales Grand Total (todas las semanas)

Período

-

Total muestras

-

Semanas epi

-

Patógenos únicos

-

Registros en BD

-

Total Pruebas

0

RSV+

0

Influenza+

0

Rhinovirus+

0

HMPV+

0

COVID-19+

0

Otros Virus

0

Total Detecciones

0

Análisis de Virus Respiratorios

Patógenos

Desde

Hasta

Años (multi-selección)

Tipo de Panel

Sin selección = Todos los paneles

Detecciones: 0

Semanas: 0

Top Patógenos (Período Seleccionado)

RSV vs Influenza vs Otros

% Positividad por Virus (de Total Runs)

Cada virus como % del total de pruebas realizadas — no suma 100%

Distribución Viral por Semana (100% Apilada)

Proporción de cada virus entre todos los detectados — suma 100%

Ranking Promedio por % Positividad

Posición promedio de cada virus en el ranking por % positividad — #1 = mayor positividad, menor valor = mejor posición

Top 5 Semanal por % Positividad

Los 5 virus con mayor % positividad cada semana — colores por virus

Resumen por Virus (Período Seleccionado)

Promedio de % positividad, % distribución y ranking mediano en el período

Subir archivos RIPS — CISML

Excel de morbilidad hospitalaria (Hospitalización o Urgencias). Claude AI detecta columnas automáticamente.

Control de Calidad — Inventario por Semana

Sem	Registros	Pacientes	Hosp	Urg	IRA	%IRA	Neum	Bronq	Asma	COVID	Sup	Inf	Diarrea

Archivos subidos

Total Registros

0

Hospitalización

0

Urgencias

0

Pacientes Únicos

0

Semanas Epi

0

Casos IRA

0

0%

Neumonías

0

Bronquiolitis

0

Asma

0

COVID-19

0

Curva Epidémica Semanal IRA

Registros: 0 Semanas: 0

Top Diagnósticos (Período Seleccionado)

Distribución por Tipo de IRA

URG y Salió

0

0%

URG → Hospitalización

0

0%

Reconsulta URG

0

0%

HOSP Directa

0

0%

Reingresos

0

0%

Crónicos Respiratorios

0

Recurrentes Frecuentes

0

Recurrentes Ocasionales

0

Esporádicos

0

Distribución de Tipos de Encuentro

Días hasta Reingreso

Días Pico Detectados

0

Media Diaria IRA

0

Máx Diario IRA

0

Clusters (p<0.01)

0

Curva Epidémica Diaria — IRA con Detección de Picos

Clusters Temporales (Poisson, p < 0.01)

Tasa Hosp. desde URG

0%

Urgencias que se hospitalizan

Tasa Reingreso 30d

0%

Reingresos / hospitalizaciones

Tiempo Prom. Reingreso

0

días promedio

Casos Críticos

0%

Proporción del total

Indicadores de Calidad Asistencial

Calculados a partir de la clasificación de encuentros clínicos (lógica Python replicada en JS).

Ventanas de Tiempo

• URG → HOSP: ≤3 días
• Reconsulta: URG → URG ≤7 días
• Reingreso: HOSP → URG ≤30 días
• Rehospitalización: reingreso → HOSP ≤3 días

Clasificación de Pacientes

• Crónico: ≥3 episodios de asma
• Recurrente frecuente: >1 evento/mes
• Recurrente ocasional: >2 eventos totales
• Esporádico: ≤2 eventos

IRA (J00-J22)

0

Total registros

EDA (A00-A09)

0

Enfermedad diarreica

Piel (L00-L08)

0

Infecciones de piel

Osteoarticular

0

M00-M03, M86

COVID-19

0

U07

Total Registros

0

Todos los RIPS

Niños (<18a)

0

0%

Adultos (≥18a)

0

0%

Distribución por Capítulo CIE-10

Distribución por Edad (Detallada)

Tendencia Semanal EDA

Relaciones Diagnósticas (Eventos)

Clasificaciones Implementadas

Respiratorio (IRA)

J00-J06: IRA Superior
J12-J22: IRA Inferior
J12-J19: Neumonía
J21: Bronquiolitis
J45-J46: Asma

Otras Infecciones

A00-A09: Diarrea/EDA
K52, R19: EDA asociado
L00-L08: Piel
M00-M03, M86: Osteoarticular
U07: COVID-19

Grupos de Edad

≤6 meses
6-12 meses
1-2 años / 2-5 años
5-12 / 12-18 años
18-65 / >65 años

Registros RIPS Hospitalario

Últimos 100 registros

Fecha	Documento	Edad	Género	Dx Código	Diagnóstico	IRA	Servicio

Cruce de Datos: Morbilidad vs Circulación Viral

Superpone eventos clínicos RIPS/CNAF (barras) con % positividad de virus (líneas) por semana epidemiológica.

Años

Barras: RIPS (morbilidad)

Barras: Asistencia VM / Terapia Respiratoria

Area

Tipo Encuentro

Grupo de Edad

Diagnostico

IRA Superior / Inferior

Genero

Ninos / Adultos

Semana Desde

Semana Hasta

Gravedad IRA

Severidad Compuesta

Tipo Paciente

Riesgo Reingreso

Turno Ingreso

Capitulo CIE-10

Granularidad

Líneas: Virus (% positividad)

Eventos clínicos: 0

Virus seleccionados: 0

FASE I — Análisis Individual de Cada Serie

Pasos 1–12 del protocolo · Ejecutado para prescripciones y cada virus seleccionado

1. Calidad de Datos

Valores faltantes, outliers (IQR), inflación de ceros, tamaño muestral

2. Estadísticos Descriptivos y Distribución

Media, DE, asimetría, curtosis, CV + tests de normalidad (Jarque-Bera, Shapiro-Francia)

3. Detección de Tendencia

Mann-Kendall test + Pendiente de Sen (magnitud robusta de tendencia)

4. Análisis de Estacionalidad

Periodograma (DFT) + Kruskal-Wallis por posición estacional

Descomposición Clásica Aditiva

Tendencia (media móvil centrada) + Estacionalidad (promedio de detrended) + Residual

5. Estacionariedad (3 Tests + Voto Mayoritario)

ADF + KPSS + Phillips-Perron · Determinación del orden de integración I(d)

6. Autocorrelación (ACF) y Autocorrelación Parcial (PACF)

Estructura de dependencia temporal — bandas = IC 95% (±1.96/√n)

7. No Linealidad (BDS Test)

Test BDS sobre residuales — detecta dependencia no lineal no capturada por modelos lineales

8. Quiebres Estructurales

CUSUM + Segmentación binaria (Bai-Perron simplificado, máx. 3 quiebres)

9. Heterocedasticidad

ARCH-LM test — detecta varianza condicional cambiante en el tiempo

10. Modelo ARIMA Automático

Grid search ARIMA(p,d,q) con p,q ∈ {0..3} · Selección por AICc · Método Hannan-Rissanen

11. Diagnóstico de Residuales del Modelo

Ljung-Box (autocorrelación) + Jarque-Bera (normalidad) + ARCH-LM (heterocedasticidad) + Durbin-Watson

12. Ficha Resumen por Serie

Resumen de FASE I — Input obligatorio para FASE II

FASE II — Análisis Pareado

Pasos 13–20 · Relación entre circulación viral y prescripciones de antibióticos

13–14. Compatibilidad y Órdenes de Integración

Verificación de alineación + comparación I(d) → determina camino analítico

15. Cointegración (Engle-Granger)

¿Existe equilibrio de largo plazo entre las series? Solo aplica cuando ambas son I(1)

16. Correlación Cruzada (CCF) — con Pre-whitening

Pre-whitening AR(3) elimina autocorrelación. Lag positivo = virus precede prescripciones.

17. Coherencia Espectral

Correlación en el dominio de frecuencias — ¿a qué ciclos están más asociadas las series?

18. Causalidad de Granger Bidireccional

¿Virus → Prescripciones? ¿Prescripciones → Virus? Incluye Toda-Yamamoto cuando I(d) difiere

Sensibilidad de Granger a Ventanas de Lag

Estabilidad del resultado: si Granger es significativo en múltiples ventanas, el hallazgo es robusto

19. Función Impulso-Respuesta (IRF) + Descomposición de Varianza (FEVD)

IRF con IC 95% bootstrap (200 réplicas) + FEVD: % de varianza de prescripciones explicada por cada virus

20. Regresión con Lag Óptimo + Fracción Atribuible

Cuantifica la asociación · FA calculada sobre series en niveles

Conclusión Final — Árbol de Decisión Algorítmico

Protocolo v3.0 · 20 pasos · 2 fases · VIRAL — CISML Colombia

Interpretación Epidemiológica con IA

Claude analiza cada resultado como epidemiólogo experto en series temporales

Desde

Hasta

Población

Piso

Diagnóstico

Turno

Soporte O2

Sin datos

Hospitalizados

0

Pediátricos

0

Adultos

0

Ingresos Hoy

0

Egresos Hoy

0

PEWS/NEWS ≥5

0

Mapa del Hospital — Pacientes por Piso

Pacientes por Semana Epidemiológica

Agrupar por

Censo de Pacientes — Último día

Fecha	Piso	Hab	#Adm	Paciente	Edad	Sexo	Estado Ini	Estado Fin	Diagnóstico	Plan	Priorización	PEWS/NEWS M	PEWS/NEWS T	PEWS/NEWS N	Tipo O2	Cant O2	Terapeuta AM	Terapeuta PM	Terapeuta Noche	Entidad

Categorías Dx

0

Estancia Promedio (días)

0

Total Ingresos

0

Fallecimientos

0

Categorías Diagnósticas

Top 10 Diagnósticos

Pirámide Poblacional (Edad x Sexo)

Ingresos y Egresos por Día

Estancia Promedio por Categoría

Distribución de Entidades

Leve

0

Moderado

0

Grave

0

CNAF Activos

0

MNR/Soporte Alto

0

TQT

0

Fallecidos

0

Desglose Soporte O2 por Tipo

Distribución Soporte O2 por Semana Epidemiológica

Distribución Actual Tipos de O2

Inicios CNAF por Semana Epidemiológica

Escalamiento O2 (cambios de soporte por admisión)

Paciente	Piso	Fecha	Cambio O2	PEWS/NEWS

Heatmap PEWS/NEWS — Piso x Turno

Horas O2 por Turno (diario)

Tendencia PEWS/NEWS por Paciente

Alertas — Pacientes en Deterioro

Paciente	Piso	Tendencia	Último Score	O2

Distribución de Priorización

Total Actividades

0

Act. Mañana

0

Act. Tarde

0

Act. Noche

0

Actividades por Día (Apiladas por Tipo)

Perfil de Actividades por Turno (Radar)

Desglose por Tipo de Actividad y Turno

Actividad	Mañana	Tarde	Noche	Total	%

Volumen por Semana Epidemiológica

Tipos de Educación al Egreso

Mediana T1 (Orden→Aviso)

— min

Mediana T2 (Orden→TR)

— min

<30 min

0%

30-60 min

0%

>60 min

0%

Distribución de Tiempos (Histograma)

Tiempos por Turno (Box Plot)

Tiempo vs Severidad (Scatter)

Tiempo Promedio por Semana

Registros con Tiempos Calculados

Fecha	Paciente	Piso	Priorización	T1 (min)	T2 (min)	Score

Terapeutas Activos

0

Prom. Pacientes/Terapeuta

0

Max Carga

0

Pacientes por Terapeuta por Turno

Actividades por Terapeuta

Cobertura por Piso y Terapeuta

Terapeuta	Turno	Pacientes	Pisos	Sev. Promedio	Total Act.

Desde

Hasta

Mes

Semana Epi

Tipo Soporte

Ubicación

Género

Destino Egreso

Eventos Adversos

Movilización

Reingreso

Total Pacientes

--

VMI

--

VMNI

--

CNAF

--

Prom. Días Estancia

--

Eventos Adversos

--

Reingresos

--

Distribución por Tipo de Soporte

Pacientes por Mes

Duración Promedio por Tipo (días)

Destino Egreso

Soporte Ventilatorio por Semana Epidemiológica

Destete CNAF

Movilización Temprana

Listado de Pacientes

Fecha	Nombre	Edad	Diagnóstico	Tipo O2	Días Est.	Días VMI	Días VMNI	Días CNAF	Destino	Eventos Adversos

Total Notificaciones

--

Ultimo periodo

Sobre Umbral

--

Territoriales con exceso

Semana Pico

--

Mayor actividad

Mayor Territorial

--

Mas casos

Canal Endemico IRA - Tendencia por Semana Epidemiologica

Top 10 Territoriales (Total Casos)

Heatmap: Territoriales x Semanas Epidemiologicas

Canal Endemico: Casos vs Umbral Estacional vs IC 95%

Area sombreada = intervalo de confianza 95%. Linea roja = umbral estacional. Puntos = casos observados.

Tendencia Multiannual por Semana Epidemiologica

Registros SIVIGILA

0 registros

Semana	Año	Territorial	Tipo	Canal	Casos	Umbral	LI IC95	LS IC95	Estado